植物园站是广州地铁6号线（未来广州地铁23号线也会经过本站）的一座车站，未开通。由于该站出入口和风亭的徵借地出现问题，故在6号线二期开通之后列车飞过该站。
记者从广州地铁处了解到，柯木塱站和植物园站确实无法与六号线二期全线同时开通。「位于柯木塱村地块内的柯木塱站的3个出入口及1组风亭，还有位於天源路南侧的君林天下社区和世纪绿洲社区的地块内植物园站，3个出入口和2组风亭，都因徵（借）地拆迁的问题，至今仍无法进场施工。」地铁一名工作人员解释。
据悉，风亭是地铁站内通风保障。按照消防要求，有2个出入口就可以开通地铁站，但风亭则一个不能少。作为重大市政工程，除非特殊原因，地铁规划一般难以修改。另外，风亭建设还要兼顾环评要求，不能靠居民区太近，因此风亭的选址没有很多选择馀地。
地铁公司称，地铁建设的一大难题便是徵（借）地拆迁。由于拆迁工作由政府相关部门协调，因此地铁公司方面也不知具体协商失败的原因。「这两站何时能开通，取决于徵（借）地拆迁的进展，因此现在无法预计开通时间。目前正与各方共同努力、加强协调，一旦场地交付地铁施工方即加紧施工，争取早日开通。」该工作人员称。
广州地铁六号线
广州地铁六号线一期长24.3KM，设车站22个；二期长17.6KM，设车站10个。由于一期工程受到拆迁的问题导致延期，将与二期一起于2013年全线开通。
六号线一期工程（浔峰岗—长湴）全长24.3公里，设车站22个：浔峰岗、横沙、沙贝、河沙、坦尾、如意坊、黄沙、文化公园、一德路、海珠广场、北京路、越秀南、东湖、东山口、区庄、黄花岗、沙河顶、沙河、天平架、燕塘、天河客运站、长湴。其中浔峰岗、横沙、沙贝为高架车站。值得一提的是，五号线坦尾站为高架车站，六号线坦尾站为地下车站，因此该站将采用高架—地下的换乘设计。
六号线工程（长湴—香雪）全长17.6公里，设车站10个。各站为：华南植物园、龙洞、柯木塱、高塘石、黄陂、香山路、科学城东、暹岗、萝岗、香雪。二期全部为地下线。
广州地铁6号线2期使用6节直线电机列车运行，与一期分开独立运行，于华南植物园换乘一期。
一期（浔峰岗——长湴）定于2013年底开通，但当中有个别站点，例如沙河等因为拆迁或其他问题影响土建进度，在6号线一期通车的时候暂时无法启用，届时列车途径这些站点的时候直接飞站
6号线2期（长湴——萝岗）也在建设中，应该是2015年左右开通的。
广州地铁6号线於2005年6月28日开始建造，西起白云区金沙洲的浔峰岗，向东南穿越荔湾区、越秀区，之後折向东北，经天河区，止於长湴（二期止於黄埔区香雪，广州地铁6号线二期将于今年8月移交轨道交通运营,接着进行测试3个月,预计12月开通运营。）。
广州地铁6号线於2013日12月28日下午2时开通试运营，全程全长24.5公里。
