去日本旅游，自由行可以玩的非常随性，不用迁就别人，但是从网上找的攻略大都是比较常规的线路，没有什么新意，可能也不是自己最想去的地方，不是自己最想要的行程，要想玩的深度有特色，建议你可以找下小蝌蚪定制旅行，他们可以根据旅游者的要求做详细的行程计划，他们可以安排很多旅行社去不到的，非常具有当地特色的景点，而且还可以帮忙预订好机票，酒店，如果想自驾，他们还能租好车子，还能提供翻译机，解决旅游者的语言问题，服务很周到，你可以上他们网站看下。
不知道楼主主要去日本哪些地区玩，我上次跟众信旅游去的东京、京都、大阪玩的还挺不错的，可以到浅草寺、皇居外苑、富士山、平和公园、金阁寺等都挺不错的，尤其是日本的象征——富士山，春天去的话美丽极了~ 再说几点注意事项，首先要特别注意日本天气挺多变的，所以出门游玩的时候一定带把伞~再就是日本那边的电源口规格和国内不一样，所以要带着转换插头。最后就是去的时候最好准备点常用药，以防头疼疼脑热的~
我之前去日本是在众信那边办的，让他们帮忙办的签证和酒店机票！然后自己去东京那边玩的，我们主要是以吃为主！呵呵！走到哪吃到那
北海道、大阪、名古屋、富士山、东京、银座、奈良、京都、伊豆都可以，不建议自由行，最好跟团或者半自助游，境外旅游会涉及到很多的注意事项和问题，尤其是语言，如果你会日语还好些，其次，如果是跟团，导游会给你讲解每一个景点，和哪里比较适合游玩，如果啥都不知道就去自由行，你会乱的。
不知道楼主想去日本哪里玩呢，日本的不同的地方有不同的玩法，北海道自然风光比较漂亮，尤其是是夏天，去旅游的话最合适不过了，富良野的薰衣草庄园什么的，是最漂亮的时候！
本州岛大城市比较多，如果喜欢热闹繁华、美食购物的话，自然是东京、大阪的线路比较适合，东京的迪士尼乐园、大阪的环球影城，都可以去逛逛~喜欢文化历史或者想感受传统的日式文化的话，可以去京都、奈良，京都是日本的古都，很多建筑和庙宇都是古香古色，非常有看点，也很适合拍照！
